Оптимизация биологического микрочипа для генотипирования локуса АВ0: аналитические аспекты

/ Фесенко Д.О. Иванов П.Л. Корниенко А.Е. Земскова Е.Ю. Заседателев А.С. Наседкина Т.В.  // Судебно-медицинская экспертиза. — 2011 — №2. — С. 30-33.

Фесенко Д.О., Иванов П.Л., Корниенко А.Е., Земскова Е.Ю., Заседателев А.С., Наседкина Т.В. Оптимизация биологического микрочипа для генотипирования локуса АВ0: аналитические аспекты

Оптимизация биологического микрочипа для генотипирования локуса АВ0: аналитические аспекты

Д.О. ФЕСЕНКО1, П.Л. ИВАНОВ2, А.Е. КОРНИЕНКО1, Е.Ю. ЗЕМСКОВА2, А.С. ЗАСЕДАТЕЛЕВ1, Т.В. НАСЕДКИНА1

Optimization of the biological microchip for genotyping the AB0 locus: analytical aspects

D.O. FESENKO, P.L. IVANOV, A.E. KORNIENKO, E.YU. ZEMSKOVА, A.S. ZASEDATELEV, T.V. NASEDKINA

1Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН; 2ФГУ «Российский центр судебно-медицинской экспертизы», Москва

Настоящая работа продолжает поиск методических решений, направленных на совершенствование и оптимизацию биологического микрочипа для генотипирования локуса АВ0. Ранее в ходе тестирования прототипа биологического микрочипа на контрольной выборке препаратов с известной групповой принадлежностью было продемонстрировано, что в определенных условиях в некоторых ячейках биочипа возникают артефактные гибридизационные сигналы, что может приводить к неинтерпретируемым или даже ложным результатам генотипирования. Нами была выполнена коррекция молекулярной структуры ДНК-зондов биочипа-прототипа в плане оптимизации их гибридизационных свойств. Были разработаны и синтезированы новые ДНК-зонды и сконструированы новые варианты биочипа. Для окончательного выбора наиболее удачных вариантов, которые должны стать основой для создания оптимизированного биочипа, был проведен экспериментальный анализ гибридизационных свойств всех разработанных ДНК-зондов.

Ключевые слова: биологические микрочипы, молекулярно-генетическая экспертиза, система АВ0, типирование ДНК, типирование SNP.

The present work continues the search for methodological options facilitating the improvement and optimization of the biological microchip designed for genotyping the AB0 locus. It was shown in an earlier study designed to test a prototype biological microchip using a reference set of preparations with the known group specificity that under certain conditions some cells of the biochip appear to generate artifact hybridization signals that tend to make the results of genotyping either incorrect or difficult to interpret. We performed the correction of the molecular structure of DNA probes of the prototype biochip for the purpose of optimization of their hybridization potency. In addition, we developed and synthesized new DNA probes and designed new variants of the biochip. The experimental analysis of hybridization properties of all DNA probes thus obtained was carried out for the final choice of the most promising options suitable for the creation of the optimized biochip.

Key words: biological microchips, molecular-biological expertise, AB0 system, DNA typing, SNP typing.

ссылка на эту страницу

похожие материалы в каталогах

Генетические исследования

похожие статьи

Исследование аллельных вариантов полиморфных локусов Y-хромосомы в судебно-генетической экспертизе / Пурвэдулам Ш., Тэнуун Б., Гантуяа Б., Ганболд С. // Судебная медицина. — 2016. — №3. — С. 38-40.

Молекулярно-генетическое исследование плаценты и пуповины — случаи из практики / Кочеткова Е.А. // Судебная медицина. — 2016. — №1. — С. 45-47.

Молекулярно-генетический анализ митохондриальной ДНК в обожженных костях: еще раз о пределах возможного / Земскова Е.Ю., Бордюков М.М., Ковалев А.В., Иванов П.Л. // Судебно-медицинская экспертиза. — 2018. — №2. — С. 21-25.

Типирование тканей методами ПЦР и капиллярного электрофореза: реальность, вопросы и перспективы / Бавыкин А.С. // Судебная медицина. — 2017. — №1. — С. 48-58.

Молекулярно-генетический анализ хромосомной ДНК в обожженных костях: миф или реальность? / Земскова Е.Ю., Бордюков М.М., Нарина Н.В., Ковалев А.В., Иванов П.Л. // Судебно-медицинская экспертиза. — 2016. — №6. — С. 4-9.