Оптимизация биологического микрочипа для генотипирования локуса АВ0: аналитические аспекты

/ Фесенко Д.О. Иванов П.Л. Корниенко А.Е. Земскова Е.Ю. Заседателев А.С. Наседкина Т.В.  // Судебно-медицинская экспертиза. — М., 2011 — №2. — С. 30-33.

Фесенко Д.О., Иванов П.Л., Корниенко А.Е., Земскова Е.Ю., Заседателев А.С., Наседкина Т.В. Оптимизация биологического микрочипа для генотипирования локуса АВ0: аналитические аспекты

Оптимизация биологического микрочипа для генотипирования локуса АВ0: аналитические аспекты

Д.О. ФЕСЕНКО1, П.Л. ИВАНОВ2, А.Е. КОРНИЕНКО1, Е.Ю. ЗЕМСКОВА2, А.С. ЗАСЕДАТЕЛЕВ1, Т.В. НАСЕДКИНА1

Optimization of the biological microchip for genotyping the AB0 locus: analytical aspects

D.O. FESENKO, P.L. IVANOV, A.E. KORNIENKO, E.YU. ZEMSKOVА, A.S. ZASEDATELEV, T.V. NASEDKINA

1Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН; 2ФГУ «Российский центр судебно-медицинской экспертизы», Москва

Настоящая работа продолжает поиск методических решений, направленных на совершенствование и оптимизацию биологического микрочипа для генотипирования локуса АВ0. Ранее в ходе тестирования прототипа биологического микрочипа на контрольной выборке препаратов с известной групповой принадлежностью было продемонстрировано, что в определенных условиях в некоторых ячейках биочипа возникают артефактные гибридизационные сигналы, что может приводить к неинтерпретируемым или даже ложным результатам генотипирования. Нами была выполнена коррекция молекулярной структуры ДНК-зондов биочипа-прототипа в плане оптимизации их гибридизационных свойств. Были разработаны и синтезированы новые ДНК-зонды и сконструированы новые варианты биочипа. Для окончательного выбора наиболее удачных вариантов, которые должны стать основой для создания оптимизированного биочипа, был проведен экспериментальный анализ гибридизационных свойств всех разработанных ДНК-зондов.

Ключевые слова: биологические микрочипы, молекулярно-генетическая экспертиза, система АВ0, типирование ДНК, типирование SNP.

The present work continues the search for methodological options facilitating the improvement and optimization of the biological microchip designed for genotyping the AB0 locus. It was shown in an earlier study designed to test a prototype biological microchip using a reference set of preparations with the known group specificity that under certain conditions some cells of the biochip appear to generate artifact hybridization signals that tend to make the results of genotyping either incorrect or difficult to interpret. We performed the correction of the molecular structure of DNA probes of the prototype biochip for the purpose of optimization of their hybridization potency. In addition, we developed and synthesized new DNA probes and designed new variants of the biochip. The experimental analysis of hybridization properties of all DNA probes thus obtained was carried out for the final choice of the most promising options suitable for the creation of the optimized biochip.

Key words: biological microchips, molecular-biological expertise, AB0 system, DNA typing, SNP typing.

ссылка на эту страницу

похожие статьи

Аспекты молекулярно-генетического исследования волос человека в зависимости от их морфологических характеристик. II. Особенности генотипирования / Александрова В.Ю., Богатырева Е.А., Куклев М.Ю., Лапенков М.И., Плахина Н.В. // Судебно-медицинская экспертиза. — М., 2019. — №2. — С. 22-25.

Аспекты молекулярно-генетического исследования волос человека в зависимости от их морфологических характеристик. I. Прогностический скрининг / Александрова В.Ю., Богатырева Е.А., Куклев М.Ю., Лапенков М.И., Плахина Н.В. // Судебно-медицинская экспертиза. — М., 2019. — №1. — С. 13-16.

Содержимое костного канала фрагментов трубчатых костей как объект для определения типов гаптоглобина и идентификации личности по ДНК / Сабурина Л.М., Якушева О.Г., Теплухина М.В. // Медицинская экспертиза и право. — 2010. — №6. — С. 24-26.

Особенности анализа генотипа лица мужского генетического пола без детекции «Y» при исследовании гена амелогенина / Потеряйкин Е.С., Якубович В.С., Игнатова С.В. // Избранные вопросы судебно-медицинской экспертизы. — Хабаровск, 2019. — №18. — С. 172-174.

А не поделиться ли нам опытом? (реплика на статью П.А. Ковтуна, М.Ю. Куклева, М.И. Лапенкова, Н.В. Плахиной «Недостаточность аутосомных STR- маркеров для достоверного установления родства в дуэтах «родитель — ребенок») / Иванов П.Л. // Судебная медицина. — 2015. — №3. — С. 59-60.

больше материалов в каталогах

Генетические исследования